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作为南宁市对外开放的高层次平台，南宁综合保税区重点发展保税加工、保税物流和跨境电商等业态。原批复规划面积2.37平方公里，一期建设面积0.897平方公里，已于2017年封关运营。2024年4月26日，国务院批复同意南宁综合保税区调整规划范围，调整后规划面积为2.15平方公里，并将二期规划调整至南宁国际铁路港。二期规划面积调整后为1.254平方公里，已于2025年4月完成建设并开展联合验收。

据悉，南宁综合保税区二期规划调整至南宁国际铁路港后，将填补一期缺乏交通枢纽配套的短板，实现“港区联动”发展。未来，南宁综合保税区将依托南宁国际铁路港进一步提升保税业务量，促进全市外贸增长，深化与东盟及“一带一路”共建国家的经贸合作。